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一种基因数据分析的半监督学习算法

来源:    作者:    发布时间:2015-11-06 06:42:48    浏览量:

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  在此实验中,训练集的样本数越多,分类效果越好;对于S4VM,有标记的样本数越多,其精确度越高,而且可以看出S4VM不会出现太大的精度变化,而SVM精度变化很大,说明S4VM的鲁棒性效果非常好。

  实验2 进行去无关基因和直接降维的对比。采用了PCA+SVM、PCA+S4VM、LPP+SVM及LPP+S4VM进行了对比实验;选择315个特征基因分别降到7、10、15、30、和50维。采用SVM分类器时作为训练集,在用S4VM时采用62个样本中的3/10约 19个作为标记的数据。实验对比结果如表2所示。可以得出,无关基因作为样本中无关的属性,其存在对分类器模型的选取影响很大;LPP由于很好地保持了局部结构,其降维效果明显要比PCA好;S4VM由于考虑了多个低密度分割器,并且充分利用了无标记的数据,使其对分类器的训练有更好的贡献,其鲁棒性及精度要比直接使用标记数据的SVM分类效果更明显。

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  基因数据的主要特点是高维数和高噪音。本文基于挖掘数据本质特征的思路,采用降维和安全的机器学习技术提出一种基因数据分析的半监督学习算法。通过实验证明了算法中应用降维的有效作用,同时也显示出应用S4VM作为学习机的潜力,为该方面更深入的研究提供了重要理论和方法基础。

  参考文献

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